بخش ریه کودکان از سال 1380 در بیمارستان فعالیت خود را در رشته بیماریهای ریه ، برونکوسکو پی ، ICU  و اسپیرومتری آغاز نمود و بخش فوق تخصصی ریه در سال 1386 به صورت بخش مستقل در کنار بخش نفرولوژی شروع به کار کرد .تعداد تخت های این بخش 8 عدد می باشد که در صورت لزوم نیزاز بخش های دیگر نیز کمک گرفته می شود .این بخش از سال 1389 شروع به پذیرش و آموزش دستیار فوق تخصصی ریه کودکان نموده است. که هر سال 2 نفر فلو پذیرش می شود .درمانگاه CF برای اولین بار در سال 1388 در بیمارستان مفید شکل گرفت . بخش ریه کودکان مرجع ارزشیابی مدارک فوق تخصصی های ریه و ICU  کودکان که در خارج از کشور فارغ التحصیل شده می باشد .
بخش اسپیرومتری نیز در بیمارستان وابسته به بخش ریه و ایمونولوژی دایر می باشد

برنامه آموزشی :
شنبه ، دوشنبه و چهار شنبه 30/7 – 30/6 صبح مباحث PICU  توسط اساتید به فراگیران آموزش داده میشود
ساعت 8-7 شنبه تا چهارشنبه راند کاری PICU  و برونکوسکوپی های اورژانسی
جلسات Text review توسط اتند مربوط  با حضور کلیه دستیاران فوق تخصصی برگزار میشود
گراند راند بخش PICU  یک روز در هفته چهار شنبه ها از ساعت 11 – 30/9 می باشد .
ژورنال کلاب در روزهای شنبه هر هفته انجام می پذیرد .
برونکوسکوپی ریجیت سه شنبه ها صبح
کنفرانس های مشترک گروه ریه  با بیمارستان های دیگر هر دو ماه یکبار سه شنبه ها از ساعت 11- 30/9 صبح برگزار میشود
جلسه فالو آپ بیماران Problem Caseیک روز در هفته در روزهای دوشنبه برگزار میشود .
جلسه مشترک با رادیولوژی شنبه اول هر ماه برگزار میشود .
درمانگاه ریه 6  جلسه درد روز هفته فعال می باشد .
گزارش صبحگاهی با حضور اساتید و فلوهای ریه 5 روز در هفته
کلاس فیزیولوژی ریه صبح های سه شنبه از ساعت 30/9-8
گراند راند بخش ریه شنبه ها 30/11-30/9
کنفرانس کلاس مشترک با سایر بخش ها ماهیانه یک بار
کلاس های درون بخشی هفته ای  3-2 بار
ویزیت روزانه بیماران توسط اساتید در بخش های ریه و PICU